在各種樣品類型中，最主要的差異所在，就是它們對長波和短波紫外輻射的不同反應。概述如下：

長波(區別最為顯著)灰色及棕色天然色大溪地養殖珍珠發出微弱的橙色、黃色或綠黃色熒光。幾乎所有的“巧克力色珍珠”都發出微弱至中度、模糊的紅橙色熒光，并顯示出天然色珍珠沒有的外觀。染了銀色的珍珠樣品對長波和短波紫外光輻射都沒有任何反應。

短波“巧克力色珍珠”普遍發出微弱的綠黃色熒光，這一特征與許多未經處理的珍珠樣品相同，盡管前者的熒光強度更低一些。

紅外光譜檢測未顯示出各類珍珠的明顯差異，至少紅外光譜中沒有一種能單獨用來區分不同的珍珠類別。所有的讀數都顯示珍珠真珠質的主要成分文石所特有的吸收峰。

使用紫外-可見-近紅外反射光譜法發現，記錄自“巧克力珍珠”的吸收帶在布局上與其對應的天然色珍珠相類似，但前者的吸收帶顯然更微弱且分界不夠明晰，而且也對應于更高一級的波長。同時還觀察到，二者的光譜基線之間有實質性的差異。染色的珍珠樣品在吸收光譜方面與其對應的天然色珍珠相比，幾無相同之處。

使用拉曼和光致發光光譜法觀察，所有的珍珠都顯示強烈的光致發光。然而，經過規格化處理之后，巧克力珍珠的光致發光，比天然色珍珠更為強烈，而染銀色養殖珍珠的光致發光是最微弱的。

現在有若干家公司都在生產有巧克力色的養殖珍珠，所以可以認為有不止一種方法正用來產生這種顏色。本次研究專攻百樂麗娜珍珠公司享有所有權的兩步法處理程序。

使用化學分析的方法，主要的區別就是經染色養殖珍珠中的銀色含量，這在CCP和NCTCP樣品的讀數中是看不到的。盡管巧克力色珍珠和天然色養殖珍珠在化學性質上非常相似，但前者的鉀含量顯著低于后者。